از دهه ۴۰ خورشیدی تا سه سال قبل حسابرسی مالیاتی بیشتر به صورت سنتی توسط ممیز مالیاتی انجام می‌شد که زمینه بروز مشکلاتی همچون فرار مالیاتی، نظرات سلیقه‌ای، ناعدالتی و بعضا فساد را فراهم می‌کرد اما طی سه سال گذشته و بخصوص با راه‌اندازی سامانه مودیان از دی‌ماه سال قبل و ایجاد رویکرد داده‌محوری به جای نگاه سنتی، علاوه بر آن‌که فرارهای مالیاتی تا حد قابل توجهی کاهش پیدا کرد، سهم مالیات در بودجه نیز افزایش یافت و اعتماد عمومی نسبت به پرداخت مالیات بیشتر شد.
در دهه ۴۰ خورشیدی با ورود مقررات مالیاتی جدید در ایران حسابرسی مالیاتی توسعه یافت. در دهه ۷۰ خورشیدی با گسترش اقتصاد و افزایش معاملات مالیاتی، سازمان حسابرسی مالیاتی ایران تاسیس شد که فعالیت‌های مثبتی داشت. با این حال حسابرسی مالیاتی به صورت سنتی از طریق ممیز مالیاتی صورت می‌گرفت. سیستم‌های سنتی و دستی در تعیین مالیات، علاوه بر کندی روند، زمینه‌ساز بروز مشکلات و بعضاً فساد در این حوزه بودند.در سال ۱۳۹۸ قانون پایانه‌های فروشگاهی و سامانه مودیان به تصویب مجلس رسید و دی‌ماه ۱۴۰۲ سامانه مودیان راه‌اندازی شد. این سامانه سهم بسزایی در رشد درآمدهای پایدار دولت و جلوگیری از فرارهای مالیاتی داشته است؛ به طوری که در حال حاضر بیش از ۷۰ درصد اظهارنامه اشخاص حقوقی، بیش از ۸۰ درصد اظهارنامه اشخاص حقیقی، ۹۵ درصد پرونده‌های مالیات بر عملکرد و ۱۰۰ درصد مالیات بر مستغلات به شکل هوشمند و سیستمی مورد بررسی قرار می‌گیرد.
